Biomindmap — система, которая сделает переворот в скорости поиска терапий, способных продлить жизнь

Добрый день друзья. Многие годы я изучал различные молекулярные механизмы действия различных терапий и заносил это в табличку. На рисунке слева принтскрин фрагмента одной за таких табличек — кликните по нему мышкой, чтобы увеличить. По этой табличке можно понять, что, например, лекарство доксициклин может прямо или косвенно снижать экспрессию или количество MMP 2, MMP 3, MMP 9, mTOR, Myc, NF-kb, либо повышать PPAR alpha, PPAR delta, PPAR gamma и так далее. 

Такие молекулярные механизмы позволяют понимать, как действует на наш организм то или иное лекарство, либо какой-то фактор здорового образа жизни, а также позволяют искать потенциальные терапии, способные продлевать жизнь, либо что-то лечить.

Такие данные копятся постепенно, годами многими специалистами во всем мире. И нет этому конца и края.

Но вот однажды очень хороший программист (Алекс Инсайт — его страница в FaceBook https://www.facebook.com/alex.inside) подумал о том, почему бы не объединить все эти данные в единую базу. И создал biomindmap — систему, в которой специалисты со всего мира собирают такие данные. Зайдите по адресу https://biomindmap.com и пользуйтесь.

Пример задачи, которую хорошо и очень наглядно решает эта система. Допустим вам нужно посмотреть молекулярные пути влияния витамина b12 на внеклеточный матрикс печени при индукции фиброза. Вы можете копаться очень долго в научных исследованиях. Пройдут месяцы. А можете очень быстро все найти, используя biomindmap:

Рисунок 1. Молекулярные механизмы действия витамина b12 на деградацию внеклеточного матрикса (Extracellular matrix degradation).

  1. Заходим на News | Biolinks Digest | BioMindmap.com
  2. Нажимаем на  Extracellular matrix degradation — в результате откроется страница https://biomindmap.com/nodes/2953
  3. Далее вверху кликаем на Pathways (в переводе означает — путь).
  4. Далее находим и кликаем Build (в переводе означает — построить).
  5. В окошке для заполнения пишем Vitamin B12.
  6. Нажимаем кнопку Show me Visualisation (в переводе означает — показать мне визуализацию).
  7. Получаем схему со всеми известными молекулярными путями влияния витамина b12 на деградацию внеклеточного матрикса (рис.1). Эту картинку можно открыть, не проходя все выше рассмотренные шаги, только кликнув по ссылке — https://biomindmap.com/map/2953,360.  Либо вы можете кликнуть по рисунку 1, и рисунок откроется в оригинале на сайте. 
  8. На оригинальной схеме вы можете кликнуть по любому фрагменту рисунка и не отпуская клавиши передвигать/раздвигать фрагменты рисунка в разные стороны, чтобы лучше рассмотреть его составляющие.
  9. Система biomindmap позволяет просмотреть научные исследования, доказывающие наличие таких связей и почитать их подробно, быстро находя в них нужное содержимое.

На самом деле biomindmap умеет много чего. Но она на английском языке и подходит для умных людей. Но мы же помним, что новые сложные задачи задерживают старение нашего мозга и сохраняют нашу память в хорошем состоянии до глубокой старости, влияя на нейропластичность (видео на вебинар). Для тех, кто пишет научные работы, ищет новые потенциальные способы лечения, и просто для тех, кто изучает старение, biomindmap — это мечта. 

Чтобы эта система жила и не умерла, ее нужно продвигать. Такие хорошие начинания нельзя оставлять без внимания. Давайте в комментариях к этому посту обсудим ее и поможем в ее продвижении. Как? Вот так:

  1. Пользуйтесь этой системой.

  2. Вам чем-то она очень понравилась, помогла решить какие-то задачи? Тогда опишите в комментариях к этому посту очень коротко в виде 3 предложений то, что понравилось. Мы соберем ваши комментарии и составим рекламный пост.

  3. Вам что-то не понравилось? Тоже пишите, чтобы знать, что нужно доработать. 

Итак, давайте вместе исследовать. Поиграем у науку, либо действительно серьезно займемся наукой. Жду от Вас очень много комментариев.

Автор статьи nestarenieRU  Веремеенко Дмитрий Евгеньевич (фото слева), автор книги «Диагностика старения«основатель исследовательского проекта, изучающего терапии, направленные на продление жизни человека (slb.expert), создатель экспертной системы тераностики старения. Тел. +7 925 9244328 [email protected]

Группа nestarenieRU в Facebook https://www.facebook.com/groups/240737323171320/

Мой аккаунт в Facebook: https://www.facebook.com/nestarenieRU

YouTube-канал www.youtube.com/c/nestarenieRU

Предлагаем Вам оформить почтовую подписку на самые новые и актуальные новости, которые появляются в науке, а также новости нашей научно-просветительской группы, чтобы ничего не упустить.


 

Знаете ли вы, что сайт nestarenie.ru — объективно один из самых популярных в России ресурсов про старение и долголетие — в Яндексе, в Гугле, по количеству, качеству и лояльности аудитории. nestarenie.ru имеет потенциал, чтобы стать одним из самых популярных сайтов о борьбе со старением не только в России, но и в мире. Для этого нужны деньги. Я призываю всех сделать пожертвования, а также убедить своих друзей поступить аналогично.

  • Яндекс.Кошелек 410012847316235
  • Карта в Сбере (рубли): 4817 7602 3256 2458 (МАЙЯВИ Ч.)
  • PayPal [email protected]

Узнайте подробнее помочь развитию блога.

Рекомендуем ещё почитать следующие статьи:

  1. Метформин — самое изученное и надёжное лекарство от старости.
  2. Подробная программа продления жизни научно доказанными способами.
  3. Витамин K2 (МК-7) сокращает смертность
  4. Витамин магний снижают смертность на 34%
  5. Глюкозамин Сульфат эффективно продлевает жизнь и защищает от многих видов рака
  6. Фолаты для предупреждения раннего старения
  7. Как победить метилглиоксаль — вещество, которое нас старит.
  8. Как остановить старение человека.

Добавить комментарий

Будем благодарны, если после прочтения статьи вы оставите свои комментарии. Ваше мнение очень важно для того, чтобы материал блога был более информативным, понятным и интересным. Перед тем, как оставить свой комментарий, прочитайте Политику конфиденциальности

Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *


Чтобы подписаться на комментарии, прочитайте Согласие с рассылкой и Политику конфиденциальности, введите

28 комментариев к «Biomindmap — система, которая сделает переворот в скорости поиска терапий, способных продлить жизнь»

  1. Константин

    Действительно, незаменимый инструмент! Весьма удобен в использовании, многие, с кем поделился данным сервисом, высказали желание появления версии на русском языке.

    1. Дмитрий Веремеенко

      Рекомендует врач. Я не врач, но делюсь данными исследований. Отрезайте у ссылок http:

      Спасибо за комментарий

  2. Denis

    Дмитрий, спасибо за информацию!

    На первый взгляд, система есть «База знаний» для спецов, то есть конечному человеку она не сильно поможет. Скажем, как руководство по ремонту авто, для ее владельца — оно нужно сервису, а не ему.

    +Если бы она еще содержала блок аналитики, как у вас, который мог бы обобщать информацию и выдавать ее в виде потенциальных рекомендаций тем же врачам… Еще «погоняю» ее, напишу отзыв полнее.

    ++ А вы планируете «загрузить» в нее все свои наработки, в рамках нестарение.ру и лонгэвити?

    1. Дмитрий Веремеенко

      Рекомендует врач. Я не врач, но делюсь данными исследований. Отрезайте у ссылок http:

      Спасибо. Создатель системы собирается загонять данные с нестарениеРУ в эту систему

    2. ALeX inSide

      Блок аналитики будет. То есть любой сервис — это не финальная версия. Сейчас в биомайндмап люди систематизируют свои находки после прочтения исследований. Оцифровка нестарения.ру — важная задача, перед тем как начать давать рекомендации для вашего врача.

      Сейчас в любом объекте есть блок Pathways (Пути), там можно посмотреть какие пути снижают выбранные симптом. Или повышают.

      В планах кнопка персональных рекомендаций — выбираешь например 3 симптома и 2 цели и он тебе для них рисует общую схему.

  3. Михаил

    Очень полезный и смелый проект )
    Для новичков хорошо бы сделать альтернативные интерфейсы ввода и вывода, максимально простые и понятные. Вплоть до того, что не заставлять их вводить ссылки на источники и прочее, прочее.
    «MindMap» хорошо бы как-то упорядочивать, например, чтобы причины были всегда ниже следствий или наоборот, не показывались дублирующие связи… А то иногда не очень очень наглядно получается )
    Полезно ещё добавить какие-то более практичные use cases, кроме как поиска путей между чем-то и чем-то. Тут можно много чего напридумать, но работы дофига.

    1. Дмитрий Веремеенко

      Рекомендует врач. Я не врач, но делюсь данными исследований. Отрезайте у ссылок http:

      Спасибо

  4. Рома

    Похоже куркумин и розмариновая кислота снижают глюкозепановые сшивки… фруктоза же быстрее чем глюкоза приводит к сшивкам…также встречал информацию о том, что ромашковый чай снижает сорбитол, что также должно снижать сшивки…могут ли отдельные аминокислоты замедлять образования сшивок…?что думаете об этом, согласны с чем-нибудь? судя по всему не последнюю роль в образовании сшивок играет избыточное количество свободных радикалов с возрастом

    1. Дмитрий Веремеенко

      Рекомендует врач. Я не врач, но делюсь данными исследований. Отрезайте у ссылок http:

      Фруктоза не приводит к глюкосепановым сшивкам. 80% всех сшивок — это глюкосепан. И они самые стабильные. Фруктоза для человека очень мало вредна. Свободные радикалы не вызывают образование глюкосепана.

      1. Дмитрий

        Ну а разве фруктоза не преобразуется в D-глюкозу и, в дальнейшем, через реакции Майера, к образованию гюкосепана?

        1. Дмитрий Веремеенко

          Рекомендует врач. Я не врач, но делюсь данными исследований. Отрезайте у ссылок http:

          При гликировании фруктоза дает карбоксиметиллизин. Он опасен для короткоживущих животных, например, для мышей. Для людей с диабетом он маловреден.
          ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5227984/

      2. Артемий К.

        А вы как-то писали, что фруктоза в 10 раз сильнее глюкозы вызывает гликирование гемоглобина.

        1. Дмитрий Веремеенко

          Рекомендует врач. Я не врач, но делюсь данными исследований. Отрезайте у ссылок http:

          При гликировании фруктоза дает карбоксиметиллизин. Он опасен для короткоживущих животных, например, для мышей. Для людей с диабетом он маловреден.
          ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5227984/

      3. Наталья

        Дмитрий, Вы пишите, что фруктоза мало вредна. Разве она не даёт скачки инсулина? И какое количество фруктов в день допустимо?
        Спасибо!

        1. Дмитрий Веремеенко

          Рекомендует врач. Я не врач, но делюсь данными исследований. Отрезайте у ссылок http:

          Фруктоза не дает скачки инсулина

      4. Л.Б.

        Дмитрий, раньше кажется проходила информация, что лактоза, фруктоза хуже сахара в плане гликирования. Значит, фрукты и ягоды в рационе не навредят? Но ведь они поднимают глюкозу в крови, тогда почему это не приводит к глюкозепановым сшивкам?

        1. Дмитрий Веремеенко

          Рекомендует врач. Я не врач, но делюсь данными исследований. Отрезайте у ссылок http:

          С точки зрения гликирования при температуре они образуют больше КПГ. Но в организме человека, как мы видим многие продукты гликирования, которые не такие устойчивые, как глюкосепан с возрастом нейтрализуются или наносят малый вред, так как мало копятся. Так карбоксиметиллизин, если нет диабета, нам вообще мало вреден, а для мышей он критичен. По по сути голые землекопы, научились бороться с этими КПГ, как и люди. Но человек, как и голый землекоп и другие долгоживущие не может нейтрализовать глюкосепан.

    2. Рома

      аргинин в исследовании снижал глюкозепан …Выходит уже 3 вещества(куркумин, розмариновая кислота, аргинин) которые весьма вероятно снижают глюкозепан…что думаете о них?И какие ещё вещества могут снижать глюкозепан?

      1. Дмитрий Веремеенко

        Рекомендует врач. Я не врач, но делюсь данными исследований. Отрезайте у ссылок http:

        А также аргинин ускорял старение артерий.

        1. Л.Б.

          А в мяте раза в четыре больше, если верить

          РОЗМАРИНОВАЯ КИСЛОТА И ЕЕ СЫРЬЕВЫЕ …www.pharmpharm.ru › jour › article › download

  5. Наталья

    Дмитрий, здравствуйте!
    Если можно, уточните пожалуйста по фруктозе. Ранее была информация, что она даже вреднее сахарозы т.к. ещё сильнее повышается инсулин. Появились новые исследования? И в употреблении фруктов можно себя особенно не ограничивать?
    Спасибо за сайт!

    1. Дмитрий Веремеенко

      Рекомендует врач. Я не врач, но делюсь данными исследований. Отрезайте у ссылок http:

      При гликировании фруктоза дает карбоксиметиллизин. Он опасен для короткоживущих животных, например, для мышей. Для людей с диабетом он маловреден.
      ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5227984/

      1. Denis

        Дмитрий, а вред от соединений фруктозы с белками и жирами вроде активно муссировался — получается, что нет фактических подтверждений?
        ++В любом случае, фруктоза = быстрый сахар, то есть не более 5% в день от рациона (по калориям) — это же правило ВОЗ не отменяется, верно? То есть посыл «без ограничений» весьма коварен в таком случае )) Без ограничений, но не более 1-2 фруктов в день получается =)

        1. Дмитрий Веремеенко

          Рекомендует врач. Я не врач, но делюсь данными исследований. Отрезайте у ссылок http:

          Для животных вред и для людей а сахарным диабетом вред.
          Фруктоза усиливает ожирение при гипереалорийном питании. Для здоровых стройных людей она мало вредна в больших дозах и совсем не вредна в небольших

Добавить комментарий

Будем благодарны, если после прочтения статьи вы оставите свои комментарии. Ваше мнение очень важно для того, чтобы материал блога был более информативным, понятным и интересным. Перед тем, как оставить свой комментарий, прочитайте Политику конфиденциальности

Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *


Чтобы подписаться на комментарии, прочитайте Согласие с рассылкой и Политику конфиденциальности, введите